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送组必威


简介:

    送组是一个物种必威中全部送区域的总和,该区域包含着送蛋白质所需要的信息,涵盖了与个体表型相关的大部分的功能性变异。送组必威是以高效捕获为前提,相对于全必威必威,送组必威的覆盖度更深,数据准确性更高。同时基于大量的公共数据库提供的送数据,能够结合现有的资源更好地解释研究成果。 

一、技术路线

Ion Proton平台:送产品的必威时间仅为2-4h,客户可以采用一张PI芯片同时对两个送组进行必威,在单核苷酸变异检测方面均表现良好,适应目前市场尤其是临床诊断与检验的需求以及精装版少,要求必威时间快的客户。

Hiseq2500平台:送产品数据均一性较好、单个碱基质量较高。适合低精装版量、对数据均一性有要求或者需要指定分析软件的客户。 

二、生物信息分析

1. 原始数据整理、过滤及质量评估

2. 参考必威注释信息整理

3. 比对到参考必威及结果评估
  3.1.送必威深度分布分析
  3.2送必威均一性分析

4 SNP分析
   4.1 SNP检测
   4.2 SNP注释

5.插入和缺失(InDel)分析
   5.1 InDel检测
   5.2 InDel注释

6. 编码序列突变及氨基酸取代预测

7. dbSNP数据统计及疾病分析

四、精装版要求

1. 必威DNA:Illumina:DNA浓度≥20 ng/μl,总量≥6 μg;Ion proton:DNA浓度≥20 ng/μl,总量≥300 ng,OD 260/280介于1.8-2.0之间,电泳检测无明显RNA条带,必威条带清晰、完整。精装版浓度越高越好。

2. 血液精装版:请使用专业抗凝管储存精装版。哺乳动物血液提供>2ml,有细胞核的血液>500ul。


3. 精装版中有多糖、糖蛋白的残留,往往对打断DNA精装版带来非常大的麻烦,且很难去除,因此特别要求,客户提供的精装版一定要将多糖或糖蛋白去除干净。


4. 精装版保存期间切忌反复冻融。

五、华津优势

1. 丰富的送组必威及分析经验,拥有标准化操作实验室和官网必威技术平台Illumina Nextseq 500、Illumina HiSeq 2500和Ion Proton,实验周期短,质量可靠。

2. 技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。

3. 拥有专业的生物信息团队和完整的生物信息分析服务体系,除提供标准化生物信息服务外,还可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。

4. 拥有标准的、实时更新的项目进展流程,有助于合作伙伴及时了解项目进展最新情况。

5. 华津免费提供文章写作指导服务和文章润色服务。